微生物質譜鑒定采用先進的模塊化設計理念，使得儀器硬件的故障率低，維護簡單、方便；同時，系統采用性能先進的固態激光器，使得掃描的速度更快，激光壽命更長（為傳統氣態激光器的16倍以上）。它具有高通量、高質量精度、高靈敏度和高鑒定準確率等優點，經過十幾年的發展和臨床驗證，為臨床微生物學帶來了一次革命性的轉變。
其工作原理：
首先測得待測微生物的蛋白質指紋譜圖（PMF），然后將這些指紋譜圖與microTyperMS中的各種微生物標準指紋圖譜庫進行匹配檢索，從而完成對微生物的鑒定，一臺儀器便可同時檢測細菌和真菌。與常規的形態學分析和分子生物學鑒定方法相比，具有速度快（只需幾分鐘）、操作簡便、成本絕對低廉（降低10倍以上），準確度高（超過95%），并且同時可以進行同源性分析和常規的耐藥性分析，廣泛應用于臨床微生物，包括細菌和真菌、的高通量快速鑒定、疾控中心的微生物傳染病原的鑒定與監測、海關進出口商品的檢驗檢疫、食品生產中的微生物檢測工業、農業和環境中的細菌監測等領域，具有廣闊的市場前景和重要的社會意義。
和傳統的微生物鑒定方法相比，質譜技術鑒定微生物的優點是：
1、速度快：細菌培養后，1小時內完成數十個樣本的鑒定，可以提前5-48小時出具鑒定結果；
2、成本低：質譜技術的鑒定成本是傳統生化方法的一半左右；
3、鑒定結果準確，客觀，無需經驗豐富的專業技術人員。
微生物質譜鑒定主要應用領域：
1、臨床微生物的高通量快速鑒定；
2、疾控中心的微生物傳染病原的鑒定與監測；
3、檢驗檢疫；
4、食品生產與微生物檢測；
5、工業、農業和環境中的細菌檢測。
